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詹姆斯一. 福斯特

詹姆斯 福斯特

大学生物学特聘教授

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詹姆斯一. 福斯特-生物科学系-365滚球官网

Dr. 福斯特目前的研究重点是描述微生物生态系统中进化允许的生态结构,以及为非常大的序列数据集开发生物信息学. 他继续研究进化过程的模拟,以设计复杂的工件和优化功能. 他与生物学家密切合作, 统计学家, 数学家, 计算机科学家.

  • Beck D, Settles M, 福斯特是. OTUbase:用于操作分类单元数据的R基础架构包. 生物信息学. 2011年6月. 15;27(12):1700–1701.
  • 公里狩猎, 是培养, LJ福尼, 梅花Shuette, 戴斯。莱纳姆:贝克, Z Abdo, 路福克斯, 我威廉姆斯, 可McGuire, MA McGuire(2011)母乳中细菌群落多样性和时间稳定性的表征. 《365体育滚球》. 6(6) e21313. doi: 10.1371 /杂志.玉米饼.
  • Norris V, Zemirline A, Amar P, Audinot JN, Ballet P, Ben-Jacob E,等. 用细菌成分、细胞和种群计算:从生物计算到细菌计算. 理论Biosci. 2011年3月. 8;130(3):211–22
  • 微生物群落作为实验单位. 61年5月,2011 (5):398 - 406. 舒特等人, U, 阿卜杜Z, 福斯特是, Forney LJ(2010)高北极冰川前陆的细菌多样性, 分子生态学. 19(1):41-53. DOI 10.1111j. 1365-294X.2009.04483.x
  • 福斯特,JA, 克朗SM, Forney LJ(2009)生态网络理论在人类微生物组中的应用. 传染病的跨学科观点. 2009:6pp. doi: 10.1155/2009/839501.
  • Keitzer, M & 福斯特,JA (2007). 遗传规划中的交叉偏差. 第10届欧洲遗传规划会议论文集,LNCS 44 (4):33-44.
  • 谢尔曼,L, J. 埃文斯,JA福斯特(2006). Clearcut:用于放松邻居连接系统发育树构建方法的参考实现. 生物信息学. 15(22):2823-4. PMID: 16982706
  • 福尼,我. J.福斯特,J. A., & 莱杰,W. (2006). 健康女性的阴道菌群并不总是以乳杆菌为主. 传染病杂志. 194, 1468-1469.
  • Banzhaf W.贝斯隆,G.克里斯滕森,S.福斯特,J. A., ksampous, F.左福特,V.等。. (2006年出版). 从人工进化到计算进化:一个研究议程. Nature Reviews遗传学. 7, 729-735.
  • 埃文斯,J.谢尔曼,L., & 福斯特,J. A. (2006). 放松邻居连接:一种基于距离的快速系统发育树构建方法. 分子进化杂志. 62(6):785-92. PMID: 16752216.
  • 害羞的,来说C.,灵魂,T.,弯,S.福斯特,J. A., & 福尼,我. J. (2006). MiCA:基于终端限制性片段长度多态性(T-RFLP)的微生物群落分析工具. 微生物生态学杂志. 53(4):562-570. PMID 17406775.
  • C. Shyu谢尔曼,L.詹姆斯·A. 福斯特(2004)多序列比对的进化计算; 遗传编程和进化机器, 提供参考, 5(2) pp 121-144.
  • L. Sheneman和詹姆斯一. 福斯特(2004)进化出更好的多序列比对. Proc. 遗传与进化计算会议(GECCO), 施普林格出版社,K. Deb等人.,编,《365体育滚球》,卷3102,页. 449-460.
  • 哈里森,M. 詹姆斯·A. 福斯特(2004)共同进化故障以提高排序网络的容错性. Proc. 欧洲遗传程序会议, Springer Verlag,爱尔兰利默里克大学.  2004年9月.

  • 描述微生物生态系统的进化起源和动态, 特别是使用宏基因组数据, 重点是与人类微生物组相关的群落.
  • 探索计算生物学和生物信息学. In particular: simulations for transposable element evolution; phylogenetic inferencing algorithms; multiple sequence alignment algorithms.
  • 探索生物启发计算的技术和固有特性. In particular: applications to 生物信息学; applications to survivable hardware and software systems; use in self-repairing and fault tolerant hardware and software systems. 遗传编程,遗传算法,进化计算,可进化硬件.

  • UI教学卓越,1999年
  • IBEST创始成员
  • BCB项目创始人,首任主任
  • IBEST计算资源核心创始人

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